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2001年6月6日，经重庆市民政局批准，由中国人民银行重庆营业管理部主管，14家在渝银行业金融机构正式发起成立重庆银行业协会，履行自律、维权、协调、服务等职能。
2004年主管单位由人行改为原重庆银监局，现为重庆银保监局。2009年7月27日根据原中国银监会有关文件精神，重庆银行业协会更名为重庆市银行业协会。
经过21年的发展，协会紧跟国家改革发展步伐，协会从最初的14个会员发展到111个。协会会员大会作为最高权力机构，均按照章程的规定和要求按时召开会员大会、进行换届选举等工作，切实履行章程规定的职能。协会理事会、监事会、秘书处等组织健全。理事会现有理事19名，监事会由监事长和2名监事共3人组成，经民主选举产生。协会会长1名、专职副会长1名、副会长2名在理事中选举产生。
协会下设秘书处，为常设办事机构。现有专职工作人员30人，秘书处内设办公室、自律部、维权部、教育培训部等部门，另发起成立重庆银行业人民调解委员会(银行业消费者投诉纠纷调解中心)。协会根据行业性质和实际工作需要，现设有法律合规、零售业务、文明规范服务、利率自律、人力资源、信息科技、安全保卫、银团贷款、消费者权益保护、绿色金融、宣传工作等11个专业委员会以及外资银行、新型农村金融机构、非银行金融机构、清廉金融文化建设等4个工作委员会。在制定行业有关业务规范、公约及实施细则、业务制度、信息沟通、业务协调、调查研究、培训教育、会员权益维护等方面发挥作用。被重庆市民政局于2013年、2018年两次评为AAAAA社会组织。